Возникновение объединения незарегистрированных церквей ЕХБ или Совета церквей евангельских христиан-баптистов (СЦЕХБ) было связано с реакцией на компромисс, допущенный руководством ВСЕХБ. Как уже было подчеркнуто, вначале наиболее радикально настроенные служители, поддерживаемые властями, отлучали от церкви несогласных с новыми требованиями государства.